O mosteiro beneditino de Vilar de Frades terá sido fundado em 566 pelo bispo S. Martinho de Dume. Do primeiro mosteiro beneditino fundado no séc. XI restam parcos elementos românicos. Em 1425 é fundada e aqui sedeada uma congregação de cónegos seculares (Lóios).
O conjunto foi renovado entre o séc. XVI e XIX, sendo de assinalar, no corpo da igreja, notáveis abóbadas nervuradas manuelinas e, no mesmo estilo, o belo portal principal. Do período barroco é o retábulo-mor da igreja e valiosos azulejos do século XVIII.